POY

Opis

POY je program za filogenetsko analizo, ki podpira več vrst podatkov (npr. morfologijo, nukleotide, gene in genske regije, kromosome in celotne genome). POY je poseben v tem, da lahko izvede resnično poravnavo in sklepanje o filogeniji, tj. ni treba, da so vhodna zaporedja vnaprej poravnana. Vstavitve, izbrise in preureditve lahko nato vključite v skupni rezultat drevesa pod Največja varčnost ali v model pod Največja verjetnost. V ta namen so bili razviti številni hevristični algoritmi, ki so implementirani v POY.