| Vrsta datoteke | APK |
|---|---|
| Različica | 2.0 |
| Založnik | MIT Laboratory for Atomistic & Molecular Mechanics |
| Datum izdaje | 6. jan. 2020 |
| Datum dodajanja | 6. jan. 2020 |
| Os zahteve | Android |
| Zahteve | Requires Android 4.0.3 and up |
| Skupno prenosov | 0 |
| Cena | Free |
Opis
Ta aplikacija uporabnikom omogoča poslušanje tresljajev v beljakovinskih molekulah, ki predstavljajo osnovne gradnike življenja. Metoda za slišnost nanoskopskih vibracij proteinov temelji na algoritmu za samodejno izračunavanje vibracijskih spektrov več kot 100.000 proteinov, ki so na voljo v Protein Data Bank [1]. Nato uporabimo dobljene frekvenčne spektre proteinov za ustvarjanje slišnega z uporabo glasbenoteoretičnega koncepta transpozicijske enakovrednosti. V tem procesu so vibracije slišne v frekvenčnem območju, ki je dostopno človeškemu ušesu, pri čemer se ohranijo relativne vrednosti vibracij. Ta algoritem reproducira značilno zvenenje vsake beljakovinske molekule in omogoča igralcem, da uporabijo beljakovinske molekule kot novo vrsto glasbila.
Različni zasloni v tej aplikaciji omogočajo dostop do različnih nizov beljakovin, ki jih lahko predvajate z dotikom gumbov. Več o proteinih lahko izveste v Protein Data Bank (PDB) https://www.rcsb.org/ (vnesite štirimestno kodo v iskalno polje in izvedeli boste več o vsakem izmed proteinov).
Prvi trije zasloni omogočajo dostop do niza proteinov, kjer se vibracije, povezane z vsemi načini, predvajajo hkrati. Zadnja dva zaslona uporabnikom omogočata predvajanje 64 posameznih načinov, povezanih z enim proteinom, s kodo Protein Data Bank 5iom (ta protein je nukleozid difosfat kinaza iz schistosoma mansoni, vodnega parazita pri ljudeh).
Vibracijski spektri, ki jih določa protein, določajo novo vrsto glasbene lestvice in uglaševanja, ki je sestavljeno iz edinstvenih frekvenc, povezanih z proteinom.
Znanstvena referenca:
[1] Z. Qin, M. J. Buehler, Analiza vibracijskega in zvočnega spektra več kot 100.000 proteinskih struktur in uporaba pri sonificiranju, Extreme Mechanics Letters, Vol. 29, str. 100460, 2019. DOI: https://doi.org/10.1016/j.eml.2019.100460
(c) 2019 Massachusetts Institute of Technology (MIT), kontakt: [email protected]
OPOZORILO: Ta aplikacija proizvaja zvoke, ki lahko poškodujejo vaš sluh. Bodite previdni. Avtorji ne odgovarjajo ali jamčijo za morebitno škodo.
Aplikacijo razvil Eric L. Buehler, 20. april 2019, v1.01
