MultiGeneBlast
| Različica | 1.1.5 |
|---|---|
| Založnik | MultiGeneBlast |
| Datum izdaje | 3. apr. 2013 |
| Datum dodajanja | 4. apr. 2013 |
| Os zahteve | Windows 2003, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Zahteve | None |
| Skupno prenosov | 95 |
| Cena | Free |
Opis
MultiGeneBlast je odprtokodno orodje, ki temelji na preoblikovanju glav FASTA proteinskih vnosov NCBI GenBank, s pomočjo katerega lahko izsledi njihov izvorni nukleotid in koordinate. MultiGeneBlast lahko pomaga pri odkrivanju takih multigenskih delov za projekte sintetične biologije. Na podlagi njegovega rezultata je mogoče ustvariti sintetično knjižnico operonov za identifikacijo tistih operonov, katerih funkcija je najbližja tisti, ki jo želi uporabnik. To orodje ponuja priložnosti za identifikacijo vseh homolognih genomskih regij s kombiniranjem rezultatov posameznih zagonov BlastP na vsakem genu in razvrščanjem genomskih regij iz katerega koli vnosa v GenBank po številu zadetkov, ohranjanju sintenije in kumulativnem rezultatu Blast bitov. Iskanja po arhitekturi se lahko izvedejo, da se najdejo genomske regije z zadetki Blast v kateri koli uporabniško določeni kombinaciji aminokislinskih zaporedij.
