Optogenetics for iOS

Opis

Optogenetika je orodje, ki raziskovalcu pomaga pri izračunu potrebne optične moči za dani poskus in vivo, ki vključuje optogenetiko ali kateri koli drug eksperimentalni pristop, ki vključuje dovajanje svetlobe v globoka področja možganov prek optičnih vlaken. Različna področja možganov imajo različne optične lastnosti, ki določajo, kako se svetloba razprši in porazdeli, ko zapusti optično vlakno. Za oceno količine svetlobe, potrebne za dano eksperimentalno zasnovo, je potrebno znanje o specifičnih lastnostih sipanja izbrane možganske regije, specifičnem opsinu, ki ga je treba uporabiti, in lastnostih optičnega vlakna. Ko uporabnik vnese te parametre v APP, ta izračuna največjo globino, pri kateri lahko pričakujemo vzbujanje opsina. Globina prodiranja je narisana kot funkcija optične moči (mW), tako da lahko uporabnik vidi, kako se svetloba razprši v možganskem tkivu v določenih okoliščinah. Različica 2 podpira 17 različnih opsinov in popoln možganski atlas sipanja svetlobe za odrasle miške, ki uporabniku omogoča iskanje možganskega področja po lastni izbiri in branje specifičnega koeficienta sipanja za to posebno področje. Za znanstveno osnovo tega kalkulator, glejte Al-Juboori, Dondzillo, Stubblefield, Felsen, Lei in Klug: Lastnosti sipanja svetlobe se razlikujejo v različnih predelih možganov odrasle miši. PlosONE, v tisku. Za uporabniški priročnik in dodatne informacije obiščite www.optogeneticsapp.com. Na voljo sta različici Pro in Lite. Različici sta enaki, le da različica Pro vključuje celoten možganski atlas, sestavljen iz 43 slik/plošč, medtem ko ima različica atlas Lite le 5 plošč.