CF

compsort for Mac

Založnik: Paul A. Wilson
Mac Free
Prenesi v1.01 29 prenosi
Različica1.01
Založnik Paul A. Wilson
Datum izdaje25. avg. 2008
Datum dodajanja11. avg. 2004
Os zahteveMacintosh, Mac OS X 10.3
ZahteveMac OS X 10.3
Skupno prenosov29
CenaFree

Opis

Orodje ukazne vrstice za primerjavo podatkovnih datotek, ločenih z vejicami, z uporabo relativnih razlik za določitev najbolj podobnih konformacij. Compsort primerja podatkovne datoteke z relativno razliko, izračuna rezultat podobnosti, razvrsti rezultate v naraščajočem vrstnem redu (nižje vrednosti predstavljajo večjo podobnost), shrani X nizkih rezultatov.

Podatkovne datoteke, ki jih ustvari uporabnik, morajo biti besedilne datoteke, ločene z vejico. Vsaka datoteka predstavlja edinstveno molekulo. Vsaka vrstica v datoteki predstavlja edinstveno konformacijo molekule. Prvi stolpec v podatkovni datoteki mora biti edinstvena oznaka za konformacijo, ki jo predstavlja vrstica. Preostali stolpci so numerični deskriptorji, kot so meritve prostora razdalje.

Vrstice se kombinatorno primerjajo med datotekami. Oznake v primerjavi so povezane in shranjene z rezultati za niz vrstic. To zagotavlja način za identifikacijo konformacij, ki so povzročile dano oceno podobnosti.

Prihodnje delo vključuje:

dodajanje GUI vmesnika

objavljam članek o svojem algoritmu za modeliranje 3D farmakoforja

Vzporedna različica z uporabo MPI

Podobni programi

Alternative

Več od tega izdajalca